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2026 중도퇴사자 연말정산: 재취업·5월 종소세 신고 방법

2026.08.09 · 클린택스 편집팀 · 연말정산·근로

중도퇴사자가 이전 회사 원천징수영수증과 재취업 서류를 확인하는 모습

핵심 요약

  • 회사는 퇴직자에게 마지막 급여를 지급할 때 그 회사에서 받은 근로소득으로 중도퇴사 연말정산을 합니다.
  • 같은 해 재취업했다면 이전 회사의 근로소득 원천징수영수증을 새 회사에 제출해 두 급여를 합산합니다.
  • 연말까지 재취업하지 않았다면 다음 해 5월 종합소득세 신고로 빠진 공제를 반영해 환급을 신청할 수 있습니다.
  • 의료비·교육비·보험료와 신용카드 등은 대체로 실제 근로제공기간에 지출한 금액만 공제 대상입니다.

2026 중도퇴사자 연말정산은 퇴직월 급여에서 먼저 끝낸다

퇴직자가 마지막 급여명세서와 중도퇴사 연말정산 내역을 대조하는 모습
퇴직월 정산은 한 해 전체가 아니라 해당 회사에서 퇴직일까지 받은 급여를 기준으로 합니다.

2026 중도퇴사자 연말정산은 다음 해 2월까지 기다리지 않습니다. 회사가 퇴직하는 달의 근로소득을 지급할 때 그 회사에서 1월부터 퇴직일까지 지급한 급여와 이미 뗀 세금을 다시 계산합니다. 이는 소득세법 제134조에 따른 절차입니다.

문제는 퇴사 시점에는 연말정산 간소화 자료가 완성되지 않았다는 점입니다. 근로자가 공제신고서와 증빙을 충분히 내지 못하면 회사는 기본적인 공제만 반영해 정산하는 경우가 많습니다. 그래서 마지막 급여에서 세금을 환급받았다고 해도 의료비, 월세, 카드 사용액까지 모두 반영됐다고 단정하면 안 됩니다.

퇴직금은 이 계산에 섞지 않습니다. 마지막 월급과 미사용 연차수당 같은 근로소득은 근로소득 원천징수영수증에, 법정 퇴직금은 퇴직소득 원천징수영수증에 따로 표시됩니다. 퇴사할 때 두 서류를 구분해 받아두면 이후 신고가 훨씬 수월합니다.

퇴사 때 받을 자료확인할 항목다음 사용처
근로소득 원천징수영수증총급여·결정세액·기납부세액재취업 회사 또는 5월 신고
마지막 급여명세서연차수당·상여·환급 또는 추가징수영수증 금액 대조
퇴직소득 원천징수영수증퇴직금과 퇴직소득세근로소득과 별도 보관

같은 해 재취업했다면 이전 회사 급여를 새 회사에 합산한다

재취업한 근로자가 이전 회사 원천징수영수증을 새 회사 급여 담당자에게 제출하는 모습
같은 과세기간의 두 직장 급여를 새 회사 연말정산에서 한 번에 합치는 것이 핵심입니다.

2026년에 퇴사한 뒤 2026년 안에 새 회사로 옮겼다면 새 회사의 연말정산 때 이전 회사 급여도 합쳐야 합니다. 이전 회사의 근로소득 원천징수영수증을 새 회사 급여 담당자에게 제출하고, 연말정산 간소화 자료와 공제신고서를 함께 냅니다. 이전 회사가 돌려준 세금이나 더 걷은 세금도 영수증의 기납부세액으로 이어집니다.

원천징수영수증을 퇴사 당일 받지 못했다면 먼저 이전 회사에 요청하세요. 회사가 지급명세서를 제출한 뒤에는 홈택스의 지급명세서 조회에서도 확인할 수 있습니다. 국세청은 연말정산 종합 안내에서 중도퇴사자 지급명세서의 홈택스 상시 제출을 안내하고 있습니다.

서류를 새 회사에 내지 않아 두 직장 급여가 따로 정산됐다면 끝난 것이 아닙니다. 같은 해의 근로소득을 합치면 누진세율과 각종 공제한도가 다시 계산되므로 다음 해 5월에 두 원천징수영수증을 합산해 신고해야 합니다. 누락하면 환급을 놓치는 경우도 있지만 추가세액이 생길 수도 있습니다.

연말까지 쉬었다면 다음 해 5월에 빠진 공제를 넣는다

퇴사자가 홈택스 근로소득 신고 화면과 공제 증빙을 확인하는 모습
재취업하지 않은 경우에는 다음 해 5월 신고가 누락 공제를 되찾는 실질적인 정산 기회입니다.

2026년 퇴사 후 12월 31일까지 재취업하지 않았다면 2027년 5월 법정 종합소득세 신고기간에 홈택스에서 근로소득 신고를 할 수 있습니다. 퇴직월 정산에서 빠진 의료비·교육비·보험료·월세액 등의 증빙을 넣고 결정세액을 다시 계산해 이미 낸 세금보다 적으면 차액을 환급받는 방식입니다.

한 회사의 근로소득만 있고 퇴직월 정산이 적법하게 끝났다면 누락 공제가 없을 때 무조건 다시 신고해야 하는 것은 아닙니다. 다만 두 곳 이상 급여를 합산하지 않았거나 사업·기타소득 등 합산 대상 소득이 있다면 신고 의무부터 확인해야 합니다. 2026년 귀속의 정확한 신고기한과 홈택스 화면은 2027년 국세청 공지를 기준으로 보세요.

신고 화면에서는 원천징수영수증의 총급여, 근로소득금액, 결정세액, 기납부세액이 자동으로 불러와졌는지 먼저 맞춥니다. 그다음 간소화 자료에서 근무월만 선택하고 누락 영수증을 추가합니다. 제출 뒤에는 종합소득세 접수증과 환급계좌, 개인지방소득세 연계 신고까지 확인해야 마무리됩니다.

2026년 퇴사 후 상태처리 방법
같은 해 다른 회사 재취업이전 원천징수영수증을 새 회사에 제출해 합산 연말정산
연말까지 미취업·누락 공제 있음2027년 5월 근로소득 종합소득세 신고
두 직장 급여를 합산하지 않음다음 해 5월 두 근로소득을 합산 신고
근로 외 사업·기타소득 있음합산 대상과 분리과세 여부를 확인해 신고

공제자료는 퇴사 전 사용분과 연간 사용분을 나눠 본다

중도퇴사자가 달력에서 근무월을 표시하고 의료비 카드 월세 증빙을 분류하는 모습
간소화 자료가 전부 조회되더라도 공제 항목별로 인정되는 지출기간은 다릅니다.

중도퇴사자가 가장 자주 틀리는 부분은 간소화 자료에 보이는 연간 금액을 그대로 넣는 것입니다. 국세청의 근로소득 세액공제 안내에 따르면 보험료·의료비·교육비 특별세액공제는 근로제공기간에 지출한 비용이 대상입니다. 신용카드 등 사용금액도 근로기간 사용분을 기준으로 확인합니다.

예를 들어 6월 30일 퇴사 후 재취업하지 않았다면 7월 이후 병원비와 카드 사용액을 근로소득 공제에 넣기 어렵습니다. 반면 기부금처럼 근로기간 제한을 같은 방식으로 적용하지 않는 항목도 있고, 국민연금보험료·연금계좌 납입액 등은 각 공제의 별도 요건을 봐야 합니다. 홈택스에서 월별 자료를 선택할 때 항목 이름만 보고 일괄 체크하지 마세요.

월세액과 주택자금 공제는 무주택 세대주, 총급여, 계약·차입 시점 같은 요건도 함께 붙습니다. 퇴사 전 지출분이라는 이유만으로 자동 공제되는 것은 아닙니다. 임대차계약서, 주민등록표, 이체내역과 대출서류를 준비한 뒤 해당 연도 요건을 대조하는 편이 안전합니다.

퇴사 직후 해두면 좋은 네 가지

  • 영수증 요청: 근로소득 원천징수영수증과 마지막 급여명세서를 받아 금액을 맞춥니다.
  • 재취업 제출: 같은 해 새 직장에 들어가면 이전 회사 영수증을 급여 담당자에게 냅니다.
  • 근무월 표시: 간소화 자료에서 실제 근로한 달을 따로 기록해 과다공제를 막습니다.
  • 5월 일정: 미취업 또는 미합산 급여가 있다면 다음 해 5월 신고 여부를 확인합니다.

퇴사 전후 급여를 합쳐 예상세액을 확인하려면

이전 회사와 새 회사의 총급여·기납부세액을 준비해 연말정산 계산기에서 예상 환급액을 확인하세요. 근로 외 소득까지 있다면 종합소득세 계산기로 합산 결과를 비교할 수 있습니다.

이 글은 2026년 8월 9일 현재 소득세법과 국세청 안내의 일반 기준을 설명한 참고 자료입니다. 실제 신고 의무와 공제 가능액은 재취업 시점, 다른 소득, 주택·부양가족 요건과 2026년 귀속 개정사항에 따라 달라질 수 있습니다.

자주 묻는 질문

2026년에 퇴사하면 회사가 연말정산을 해주나요?
회사는 퇴직하는 달의 근로소득을 지급할 때 퇴직일까지의 급여로 중도퇴사 연말정산을 합니다. 다만 간소화 자료가 완성되기 전이라 의료비·월세 등 일부 공제가 빠질 수 있습니다.
같은 해 재취업하면 이전 회사 원천징수영수증을 꼭 내야 하나요?
새 회사가 이전 회사 급여까지 합산해 연말정산하려면 근로소득 원천징수영수증을 제출해야 합니다. 제출하지 않아 급여가 따로 정산됐다면 다음 해 5월에 합산 신고해야 합니다.
퇴사 후 재취업하지 않으면 다음 해 5월에 반드시 신고하나요?
한 회사의 근로소득만 있고 퇴직월 정산에 누락이 없다면 무조건 다시 신고하는 것은 아닙니다. 빠진 공제를 반영해 환급받으려는 경우, 여러 급여를 합산하지 않은 경우나 다른 합산 대상 소득이 있는 경우에는 신고 여부를 확인해야 합니다.
퇴사 후에 쓴 병원비와 카드값도 공제받을 수 있나요?
의료비·보험료·교육비와 신용카드 등은 원칙적으로 근로제공기간에 지출한 금액을 기준으로 봅니다. 기부금과 연금 관련 공제처럼 별도 기준을 적용하는 항목은 따로 확인해야 합니다.
원천징수영수증을 못 받았으면 어떻게 하나요?
먼저 이전 회사에 발급을 요청하고, 회사가 지급명세서를 제출한 뒤에는 홈택스 지급명세서 조회에서 확인할 수 있습니다. 조회 전이라면 급여명세서와 입금내역도 함께 보관하세요.